More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0683 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  77.53 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  73.03 
 
 		 267 aa  411  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  74.53 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  74.34 
 
 		 270 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  73.03 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  73.78 
 
 		 267 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  36.61 
 
 		 258 aa  174  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  35.66 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  34.8 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  34.46 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  39.37 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  40.36 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  39.11 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  39.22 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.86 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.02 
 
 		 700 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  40.43 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.46 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.98 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  36.61 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  36.94 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  35.52 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  39.1 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  36.65 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  35.43 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  34.7 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  36.14 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.04 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  34.52 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.69 
 
 		 279 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.93 
 
 		 723 aa  161  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.97 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5480  tryptophan synthase, alpha subunit  35.69 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.428541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  36.86 
 
 		 715 aa  159  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  37.3 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  38.1 
 
 		 671 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  35.11 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  34.31 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  35.14 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  35.88 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  35.88 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  37.18 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  35.16 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  35.16 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  36.13 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  33.98 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  33.21 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  36.11 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>