More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0501 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  75.66 
 
 		 267 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  75.66 
 
 		 267 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  75.94 
 
 		 270 aa  425  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  77.9 
 
 		 267 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  74.53 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  69.29 
 
 		 268 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  36.15 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  36.12 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.74 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.07 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  39.34 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  36.59 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.72 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 285 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  37.82 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  35.09 
 
 		 700 aa  170  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  39.17 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.09 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.72 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.08 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.3 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  37.6 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.34 
 
 		 723 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 279 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  39.27 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  36.99 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  34.66 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.33 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  37.19 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  36.57 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  36.95 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  36.16 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  38.52 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.4 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  33.96 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  35.86 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  36.55 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  38.35 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  35.21 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>