More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0840 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  80.15 
 
 		 267 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  75.85 
 
 		 270 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  75.66 
 
 		 267 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  73.78 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  73.03 
 
 		 267 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  73.03 
 
 		 267 aa  411  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 253 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  38.91 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  43.21 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.94 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.19 
 
 		 700 aa  176  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  37.87 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  39.37 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  37.1 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  35.71 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.46 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  38.67 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  35.21 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.14 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  37.01 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  37.71 
 
 		 715 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  34.59 
 
 		 723 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.31 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1661  tryptophan synthase, alpha subunit  37.02 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.342631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  38.26 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  38.49 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  39.26 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.3 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  36.15 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  36.99 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  37.26 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  34.35 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  38.31 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.21 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  37.35 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.84 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>