More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1933 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  80.15 
 
 		 267 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  77.9 
 
 		 267 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  77.36 
 
 		 270 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  73.03 
 
 		 267 aa  421  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  73.78 
 
 		 268 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  73.78 
 
 		 267 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  35.6 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  39.69 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 261 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  40.07 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.02 
 
 		 700 aa  172  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  36.09 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  34.14 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  38.8 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.47 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  37.27 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  35.39 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  38.96 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.4 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  39.36 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.15 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  39.26 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.15 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  34.82 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  36.16 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  37.31 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  34.55 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  38.06 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.93 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 266 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  37.66 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  38.75 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.15 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  34.12 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  35.09 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  34.72 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.97 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  35.89 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  34.62 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.65 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  35.59 
 
 		 715 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  35.43 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  38.37 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 275 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  38.33 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 269 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  34.43 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  35.71 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  35.92 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  35.97 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>