More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0545 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  75.85 
 
 		 267 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  75.94 
 
 		 267 aa  425  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  73.58 
 
 		 267 aa  421  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  77.36 
 
 		 267 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  74.34 
 
 		 267 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  70.57 
 
 		 268 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.47 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  38.24 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  35.37 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  39.23 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.58 
 
 		 700 aa  174  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  37.21 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  44.09 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  36.02 
 
 		 723 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  38.93 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  37.4 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  34.82 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.94 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  35.1 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  35.94 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  35.53 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  34.33 
 
 		 715 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.83 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  39.01 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  32.18 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  33.58 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.45 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  35.25 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  35.95 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 271 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  40.24 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  33.96 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  35.92 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  37.77 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  34.43 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.37 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.3 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  33.21 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  37.68 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.15 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  32.95 
 
 		 671 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  35.87 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  34.71 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  36.59 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  32.95 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>