More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4867 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  79.21 
 
 		 269 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  78.49 
 
 		 269 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  79.35 
 
 		 285 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  75.63 
 
 		 269 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  75.18 
 
 		 272 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  73.74 
 
 		 272 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  72.92 
 
 		 285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  71.94 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  66.19 
 
 		 271 aa  338  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  61.29 
 
 		 265 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  60.57 
 
 		 265 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  61.29 
 
 		 265 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  59.86 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  63.44 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  59.86 
 
 		 265 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  60.93 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  54.48 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  55.76 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 		 272 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  60.65 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  56.12 
 
 		 271 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  53.41 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  54.48 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  53.6 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  53.41 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  57.55 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  52.86 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  56.83 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  51.25 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  51.58 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  51.08 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  50 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  48.75 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  53.93 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  50 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  50.18 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  52.31 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  54.3 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  49.46 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  45.74 
 
 		 270 aa  241  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  44.76 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  50.38 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  50.38 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  42.14 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  46.88 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  44.77 
 
 		 264 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.57 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  42.24 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  44.18 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.34 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.9 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  39.93 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  48.81 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  42.52 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 272 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>