More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2304 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
265 aa  526  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  89.43 
 
 
265 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  76.98 
 
 
265 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  77.36 
 
 
265 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  76.6 
 
 
265 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  73.96 
 
 
270 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  74.24 
 
 
271 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  73.58 
 
 
270 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  72.35 
 
 
271 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  71.59 
 
 
271 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  72.45 
 
 
271 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  72.24 
 
 
272 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  71.97 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  71.97 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  71.97 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  64.91 
 
 
265 aa  355  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  74.24 
 
 
271 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  63.77 
 
 
265 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  73.86 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  65.43 
 
 
269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  66.04 
 
 
273 aa  342  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  65.43 
 
 
269 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  64.66 
 
 
285 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  63.24 
 
 
272 aa  341  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  63.6 
 
 
273 aa  341  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  61.76 
 
 
272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  66.29 
 
 
271 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  60.23 
 
 
268 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  62.45 
 
 
269 aa  331  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 
285 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  61.13 
 
 
273 aa  328  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  60.22 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  65.28 
 
 
272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  62.12 
 
 
268 aa  315  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  56.82 
 
 
279 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  56.93 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  58.67 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  59.7 
 
 
266 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  57.09 
 
 
267 aa  298  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  59.55 
 
 
277 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  59.78 
 
 
270 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  56.77 
 
 
271 aa  293  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  54.48 
 
 
268 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  54.24 
 
 
272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  59.58 
 
 
272 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  59.58 
 
 
272 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  52.61 
 
 
270 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  55.97 
 
 
274 aa  275  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  51.1 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  50.92 
 
 
278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  50.18 
 
 
272 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 
268 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 
268 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  47.74 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 
272 aa  252  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  52.45 
 
 
273 aa  248  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  53.93 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  48.29 
 
 
264 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
270 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  48.15 
 
 
268 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  54.92 
 
 
269 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
268 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 
269 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 
269 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 
269 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
269 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  45.39 
 
 
277 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 
267 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 
271 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  47.33 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  44.83 
 
 
279 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  45.08 
 
 
270 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 
281 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 
267 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  44.11 
 
 
267 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 
271 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  46.15 
 
 
269 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 
278 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  49.43 
 
 
269 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  46.25 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  44.28 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 
272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  48.75 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  44.15 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 
279 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  46.09 
 
 
265 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  45.57 
 
 
279 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 
274 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  43.45 
 
 
269 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  42.42 
 
 
279 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>