More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1301 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
266 aa  521  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  77.04 
 
 
271 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  73.96 
 
 
264 aa  359  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  54.78 
 
 
270 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  55.76 
 
 
269 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  56.51 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  56.13 
 
 
269 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  55.39 
 
 
269 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  53.9 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  53.68 
 
 
269 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  53.9 
 
 
268 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  53.36 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  53.36 
 
 
270 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  52.79 
 
 
269 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  52.19 
 
 
279 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  54.61 
 
 
278 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  52.92 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  52.01 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  54.07 
 
 
278 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  51.82 
 
 
279 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  51.82 
 
 
279 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  51.64 
 
 
277 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  55.74 
 
 
278 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  52.96 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  54.7 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 
279 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  50.75 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 
279 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  51.87 
 
 
279 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  50.92 
 
 
281 aa  241  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  51.66 
 
 
277 aa  239  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  53.85 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  52.38 
 
 
275 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  54.38 
 
 
281 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  51.25 
 
 
263 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  51.25 
 
 
263 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  50.85 
 
 
267 aa  234  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  53.76 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  53.03 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  53.33 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  47.94 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  50.18 
 
 
280 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  49.43 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  49.82 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  53.52 
 
 
271 aa  231  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 
264 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 
265 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 
263 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.59 
 
 
268 aa  218  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.09 
 
 
267 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  46.1 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  55.56 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  42.25 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.09 
 
 
256 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.68 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  45.27 
 
 
271 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  49 
 
 
276 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.7 
 
 
265 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  46.72 
 
 
273 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 
269 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  44.88 
 
 
270 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  43.62 
 
 
271 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  43.9 
 
 
276 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 
267 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  45.89 
 
 
270 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  47.3 
 
 
265 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  49.19 
 
 
285 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  40.45 
 
 
268 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  39.38 
 
 
256 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  45.08 
 
 
269 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  45.64 
 
 
267 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  49.44 
 
 
275 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  44.15 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  48.78 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  46.09 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.24 
 
 
272 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 
272 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  48.78 
 
 
285 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  41.64 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  40.16 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.07 
 
 
272 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  40.76 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  42.62 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  46.81 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  43.66 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  42.62 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 
272 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 
272 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 
269 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  41.42 
 
 
276 aa  195  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 
278 aa  195  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  46.64 
 
 
271 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>