More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1025 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  52.76 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  40.16 
 
 		 268 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  43.94 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  45.06 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.57 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  40.07 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  42.08 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.68 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  41 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  44.06 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  44.72 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.73 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  42.98 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  42.06 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  40.51 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  45.25 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  39.1 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  42.98 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  39.76 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  42.47 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  39.36 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  42.28 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  38.11 
 
 		 723 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.06 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.47 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.02 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  37.02 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.34 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  42.55 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  38.31 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  41.79 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  35.68 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  42.39 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  38.96 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  42.15 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.6 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  42 
 
 		 671 aa  173  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>