More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1185 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 267 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  51.53 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  51.71 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  49.62 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  53.16 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.15 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  47.89 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  41.73 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  41.95 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.77 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  49.8 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 258 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  43.93 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  39.31 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  46.01 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  46.01 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  46.64 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  48.16 
 
 		 268 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  39.1 
 
 		 258 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  44.53 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  47.3 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  42.96 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  46.19 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  45 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  42.31 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  43.73 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  43.68 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  40.84 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  46.25 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.32 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  40.84 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  43.51 
 
 		 671 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  45 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  44.7 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  42.74 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  40.56 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  40.91 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  44.27 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.18 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>