More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1512 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  72.16 
 
 		 263 aa  349  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  52.74 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  45.7 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.93 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.73 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  43.48 
 
 		 261 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.61 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  41.73 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  44.19 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  41.31 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.56 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  42.24 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  39.78 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  36.11 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  42.17 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  42.75 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 268 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  37.85 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  39.27 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.52 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  39.42 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 266 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  34.52 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.74 
 
 		 302 aa  171  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.46 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  41.46 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  40.22 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  38.76 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.31 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  40.79 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.71 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.32 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  41.86 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  37.35 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  43.04 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  38.3 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 285 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  40.98 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  43.93 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  38.3 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  38.49 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>