More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3170 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  91.73 
 
 		 267 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  62.78 
 
 		 273 aa  331  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  66.02 
 
 		 266 aa  318  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  65.92 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  62.74 
 
 		 262 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  62.74 
 
 		 262 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  61.98 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  59.7 
 
 		 263 aa  307  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  63.36 
 
 		 270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  60.46 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  58.56 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  60.08 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  57.14 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  57.63 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  59.32 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  64.11 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  65.25 
 
 		 306 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  59.25 
 
 		 272 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  59.84 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  60.37 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  57.31 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  54.2 
 
 		 281 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  59.21 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  60 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  55.13 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  56.27 
 
 		 276 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  54.11 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  55.36 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  62.64 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  57.63 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.67 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  50.81 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  54.98 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.35 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.46 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.15 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  40.93 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.88 
 
 		 700 aa  175  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  45.02 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.1 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.06 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.42 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.23 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  43.1 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.1 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.08 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.96 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.89 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.33 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  39.17 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  39.37 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.82 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.24 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>