More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11629 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 270 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  82.38 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  82.38 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  81.99 
 
 		 262 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  80.46 
 
 		 262 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  79.69 
 
 		 262 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  70.04 
 
 		 275 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  66.02 
 
 		 261 aa  328  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  62.11 
 
 		 261 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  63.36 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  64.12 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  65.23 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  63.6 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  60.77 
 
 		 266 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  59.38 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  57.14 
 
 		 273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  56.55 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  59.02 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  56.97 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  62.1 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  58.14 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  58.82 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  56.42 
 
 		 281 aa  265  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  62.74 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  58.09 
 
 		 306 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  55 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  57.2 
 
 		 276 aa  255  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  64.34 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  54.2 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  58.47 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  54.66 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  56.86 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  55.6 
 
 		 272 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  56.12 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.08 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.39 
 
 		 261 aa  185  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.46 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 		 268 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.34 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.98 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.15 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  40.71 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.06 
 
 		 267 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.91 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  42.26 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  39.15 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  43.67 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.04 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  34.48 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  33.72 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  42.92 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.95 
 
 		 700 aa  166  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  38.32 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.68 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  37.45 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.45 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  42.37 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  37.79 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  41.67 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>