More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1217 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  60.89 
 
 
272 aa  327  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  56.45 
 
 
261 aa  289  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  59.92 
 
 
277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  64.13 
 
 
278 aa  288  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  61.04 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  61.04 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  61.9 
 
 
262 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  61.04 
 
 
262 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  60.92 
 
 
276 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  51.79 
 
 
289 aa  275  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  58.87 
 
 
262 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  53.01 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  59.58 
 
 
274 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 
281 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  55.23 
 
 
269 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  54.2 
 
 
266 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  57.08 
 
 
268 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  56.52 
 
 
270 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  54.27 
 
 
261 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  53.56 
 
 
273 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  53.68 
 
 
263 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  60.34 
 
 
269 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  54.94 
 
 
276 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  55.17 
 
 
272 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  54.11 
 
 
267 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  57.45 
 
 
267 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  52.54 
 
 
302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 
267 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  53.18 
 
 
264 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  56.11 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  56.96 
 
 
260 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  54.2 
 
 
270 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  58.23 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  49.25 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  51.88 
 
 
273 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  51.01 
 
 
292 aa  211  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 
263 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 
255 aa  192  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  41.11 
 
 
267 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 
255 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 
278 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  44.44 
 
 
255 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  42.23 
 
 
261 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  39.43 
 
 
700 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 
271 aa  188  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.25 
 
 
275 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 
264 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 
269 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 
280 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  41.35 
 
 
302 aa  186  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 
266 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.23 
 
 
279 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 
280 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  35.42 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 
272 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.96 
 
 
259 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.19 
 
 
266 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 
274 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38.59 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  39.42 
 
 
265 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 
267 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 
267 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  43.23 
 
 
266 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 
267 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 
267 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 
274 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  43.23 
 
 
267 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  39.82 
 
 
254 aa  175  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.99 
 
 
260 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 
269 aa  175  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.45 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.77 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.52 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  36.17 
 
 
279 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.44 
 
 
258 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  36.51 
 
 
723 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  35.82 
 
 
279 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36.33 
 
 
256 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  39.3 
 
 
263 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 
269 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.99 
 
 
274 aa  168  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  38.76 
 
 
285 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 
265 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 
269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 
269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  38.37 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 
265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.34 
 
 
270 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 
250 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>