More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3478 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3478  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.899291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  61.11 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1740  tryptophan synthase subunit alpha  61.96 
 
 		 270 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  52.96 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 255 aa  255  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  43.14 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.53 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.5 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  45.63 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  39.57 
 
 		 700 aa  172  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  42.28 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 266 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  37.96 
 
 		 723 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.04 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.17 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  39.74 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.45 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  37.04 
 
 		 671 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.3 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  42.91 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.39 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  42.29 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.23 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.68 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  40.79 
 
 		 268 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  31.78 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  39.01 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 265 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  41.95 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.91 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.68 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  40.17 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  34.32 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  34.32 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.75 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  34.75 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  34.75 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  41.92 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  35.59 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  34.75 
 
 		 258 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>