More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0403 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0403  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1681  tryptophan synthase  58.94 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.52 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.87 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.22 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  39.46 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.61 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  39.38 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  35.51 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.05 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.04 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  35.77 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  37.89 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  36.71 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  38.5 
 
 		 723 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  35.89 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.29 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  38.12 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  38.84 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.01 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.86 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.59 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.59 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 274 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  39.3 
 
 		 271 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 268 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.22 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.22 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  36.56 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  39.63 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  37.17 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 265 aa  154  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  37.99 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  38.57 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  34.39 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  35.4 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  36.55 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  37.33 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.77 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  36.65 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4374  tryptophan synthase, alpha subunit  37.61 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  37.73 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  38.33 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  37.79 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 281 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  35.6 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37.27 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  38.67 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>