More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1548 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1548  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1548  tryptophan synthase subunit alpha  63.49 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  42 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.76 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.4 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.78 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1434  tryptophan synthase subunit alpha  37.13 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1463  tryptophan synthase subunit alpha  37.13 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.46 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.85 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.95 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  36 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  35 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  35.22 
 
 		 271 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.92 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  36.44 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  34.58 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.6 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  34.25 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  36.54 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  34.16 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  34.18 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  33.6 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  35.19 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 278 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  33.75 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  33.98 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  34.58 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  33.74 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  34.58 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  35.4 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.91 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  34.39 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  35.04 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  35.34 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  31.38 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  35.56 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  31.46 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  35.92 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  36.2 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  33.05 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  36.52 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1740  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 272 aa  144  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  34.31 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0943  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.669087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  34.8 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  33.2 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  34.14 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  31.91 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  34.38 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  33.89 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  33.74 
 
 		 278 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2860  tryptophan synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  35.32 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4374  tryptophan synthase, alpha subunit  32.23 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  33.73 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  33.75 
 
 		 278 aa  141  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>