More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1094 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 269 aa  517  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4954  Tryptophan synthase  44.71 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  40.23 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.45 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 268 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  43.14 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.51 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  43.5 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  34.78 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  41.29 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.99 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  41.09 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  39.6 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  40.48 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  45.77 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.58 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.88 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.43 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  41.48 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  39.53 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  45.95 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  40 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  38.17 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  45.56 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 289 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  45.81 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  39.61 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  43 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  43.78 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1548  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  46.3 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  45.16 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  33.72 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  41.08 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  45.56 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  32.39 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  44 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  38.15 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  38 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  47.77 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>