More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 
292 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  58.23 
 
 
262 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  55.04 
 
 
275 aa  258  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  56.96 
 
 
262 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  59.11 
 
 
262 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  59.11 
 
 
262 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  59.11 
 
 
262 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  55.04 
 
 
261 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  54.01 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  56.75 
 
 
272 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  51.01 
 
 
274 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  52.07 
 
 
261 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  53.56 
 
 
273 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  57.69 
 
 
274 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  56.12 
 
 
270 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  52.34 
 
 
302 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  52.32 
 
 
263 aa  234  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  60.09 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  56.9 
 
 
273 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  63.11 
 
 
265 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  53.45 
 
 
277 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  54.98 
 
 
267 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  53.68 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  51.45 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  58.05 
 
 
276 aa  218  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.7 
 
 
272 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  57.14 
 
 
260 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  47.01 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 
267 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  54.43 
 
 
272 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  48.52 
 
 
264 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  52.89 
 
 
268 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  54.27 
 
 
270 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  49.11 
 
 
269 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  52.72 
 
 
267 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  55.11 
 
 
276 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.33 
 
 
262 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45.53 
 
 
260 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41.1 
 
 
272 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.02 
 
 
261 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 
271 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.49 
 
 
264 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 
274 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  46.35 
 
 
267 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  42.49 
 
 
302 aa  188  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  43.35 
 
 
267 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  44.08 
 
 
267 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.66 
 
 
279 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 
266 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.57 
 
 
267 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  41.32 
 
 
279 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.57 
 
 
267 aa  185  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  43.39 
 
 
279 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.84 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  43.59 
 
 
263 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  43.59 
 
 
263 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 
266 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 
268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  43.1 
 
 
268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 
267 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.56 
 
 
261 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 
290 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  43.1 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  46.78 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  36.55 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  46.78 
 
 
285 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  40.41 
 
 
279 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 
269 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  40.91 
 
 
700 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  46.35 
 
 
285 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 
271 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.04 
 
 
275 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.96 
 
 
255 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.83 
 
 
261 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 
269 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.96 
 
 
255 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 
269 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 
278 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  41.37 
 
 
278 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 
269 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 
266 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  33.89 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  39.74 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  39.74 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  37.25 
 
 
723 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  41.18 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  48.89 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  40.91 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40.46 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>