More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1548 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1548  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1548  tryptophan synthase subunit alpha  63.49 
 
 		 253 aa  325  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  43.55 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  42.17 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 258 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1434  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.19 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.66 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  35.22 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  34.14 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  34.14 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  33.6 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.92 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  34.68 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  32.77 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.04 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36.65 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  36.84 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  33.59 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  37.2 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  35.37 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  34.84 
 
 		 279 aa  151  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  36.51 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  31.08 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  34.18 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  34.05 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  33.62 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  32.82 
 
 		 268 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  35.8 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.19 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  33.33 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.67 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  34.45 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  32.4 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  32.54 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  33.98 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  33.07 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  34.38 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  32.42 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  32.64 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  31.95 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.25 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  32.16 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0943  tryptophan synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.669087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  31.25 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.1 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  32 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  32.52 
 
 		 723 aa  143  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  34.03 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  31.44 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  34.14 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  33.05 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  31.85 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  32.17 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  34.93 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  33.07 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  33.73 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  31.75 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  36.29 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  32.53 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  32.53 
 
 		 269 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  32.13 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  31.97 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  34.69 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  34.39 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  31.43 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  34.65 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  33.59 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>