More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1610 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  97.99 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  97.59 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  44.76 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  45.64 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  35.44 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  34.43 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  34.15 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 268 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.51 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  35.96 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  37.66 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  34.36 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1434  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  36.52 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  34.04 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  35.65 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.04 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  34.04 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.91 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  34.04 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5128  tryptophan synthase, alpha subunit  31.91 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.22 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  35.92 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  35.84 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  36.28 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  35.65 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  36.77 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.56 
 
 		 275 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  34.08 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  32.92 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  32.11 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  39.11 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  34.22 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  33.19 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  33.91 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  33.91 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  33.48 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  32.89 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  32.92 
 
 		 274 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.58 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  32.44 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  34.67 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  32.44 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  34.19 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  31.97 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  34.58 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  33.89 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0403  tryptophan synthase, alpha subunit  35.19 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  34.09 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 279 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  33.05 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  31.25 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  33.62 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  29.05 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  33.94 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  32.92 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  32.62 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  33.33 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  31.67 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  32.31 
 
 		 304 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  34.38 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  34.05 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  32.6 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2818  tryptophan synthase, alpha subunit  31.74 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 263 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1548  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  32.74 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  29.39 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0943  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.669087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  34.2 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>