More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0354 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  58.63 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  59.27 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  57.83 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  54 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  41.43 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  43.21 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  43.04 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.26 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.7 
 
 		 265 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.85 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  39.92 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  38.71 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  34.66 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  41.07 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  35.62 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.76 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.3 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.99 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  37.96 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  36.44 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  34.82 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  38.57 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  35.22 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  35.74 
 
 		 700 aa  159  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.48 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  36.21 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  34.51 
 
 		 723 aa  158  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.63 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  34.82 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  34.82 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  37.99 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1434  tryptophan synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 279 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 277 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.13 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  36.56 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  34.89 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  34.03 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1548  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  36.16 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  36.17 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  35.11 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  34.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  32.07 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.17 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  32.07 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>