More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1501 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  66.67 
 
 
272 aa  340  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  68.03 
 
 
278 aa  308  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  67.29 
 
 
269 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  60.92 
 
 
274 aa  298  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  61.36 
 
 
277 aa  285  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  54.78 
 
 
289 aa  284  9e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  58.17 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  57.79 
 
 
262 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  57.79 
 
 
262 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  58.21 
 
 
268 aa  278  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  55.47 
 
 
281 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  57.41 
 
 
262 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  59.78 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  54.58 
 
 
269 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  58.57 
 
 
261 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  56.27 
 
 
267 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  56.54 
 
 
261 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  55.51 
 
 
262 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  54.24 
 
 
275 aa  268  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  54.12 
 
 
273 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  58.67 
 
 
274 aa  265  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  57.03 
 
 
267 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  65.25 
 
 
276 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  57.2 
 
 
270 aa  262  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  54.85 
 
 
272 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  54.15 
 
 
263 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  62.15 
 
 
306 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  55.65 
 
 
264 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  60.3 
 
 
273 aa  245  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  55.73 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  53.73 
 
 
267 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  56.83 
 
 
302 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  62.99 
 
 
265 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  52.53 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  54.02 
 
 
270 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  57.63 
 
 
292 aa  211  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.62 
 
 
261 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.72 
 
 
267 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.97 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 
267 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.55 
 
 
279 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 
261 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.08 
 
 
261 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 
271 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.22 
 
 
272 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
255 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
255 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.58 
 
 
271 aa  175  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  39.23 
 
 
302 aa  175  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.8 
 
 
700 aa  173  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.98 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.08 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.95 
 
 
256 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 
268 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  30.53 
 
 
262 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  32.64 
 
 
279 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 
267 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 
259 aa  168  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  34.58 
 
 
275 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 
271 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  40.42 
 
 
270 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  32.27 
 
 
254 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  38.75 
 
 
271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 
269 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.2 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  33.99 
 
 
259 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.57 
 
 
266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  33.75 
 
 
280 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  32.48 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  32.16 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  32.92 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  33.6 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  37.16 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.76 
 
 
266 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  40.87 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 
269 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 
259 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  38.93 
 
 
290 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.93 
 
 
267 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.58 
 
 
270 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  44 
 
 
269 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 
269 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 
278 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 
269 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 
290 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 
279 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 
265 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 
269 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 
250 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 
266 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 
269 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  30.74 
 
 
268 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.73 
 
 
277 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>