More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3015 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 273 aa  511  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  78.28 
 
 		 306 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  62.78 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  62.78 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  60.15 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  61.19 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  61.34 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  61.65 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  58.05 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  55.6 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  54.85 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  59.48 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  64.47 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  61.42 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  53.51 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  61.87 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  59.17 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  59.53 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  66.17 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  60.3 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  61.26 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  55.26 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  56.65 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  59.85 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50.94 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  60.22 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  49.07 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  53.38 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  52.34 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  53.74 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  56.9 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  50.86 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  51.91 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  45.61 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  40.16 
 
 		 700 aa  192  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.84 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.29 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.77 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  42.02 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  43.04 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.93 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  46.06 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.93 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.93 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  37.19 
 
 		 723 aa  176  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  39.92 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.93 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.93 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.71 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  38.36 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  42.24 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.15 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  40.15 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  41 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4954  Tryptophan synthase  44.67 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.02 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  42.23 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>