More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2047 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  99.63 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  97.42 
 
 		 271 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  82.84 
 
 		 268 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  81.72 
 
 		 268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  80.97 
 
 		 268 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  78.73 
 
 		 269 aa  434  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  78.95 
 
 		 269 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  77.99 
 
 		 268 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  77.99 
 
 		 268 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  77.99 
 
 		 268 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  77.99 
 
 		 268 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 268 aa  410  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  79.1 
 
 		 268 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 268 aa  410  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 268 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  79.1 
 
 		 268 aa  410  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  77.61 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  77.9 
 
 		 269 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  78.73 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  78.73 
 
 		 268 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  77.99 
 
 		 268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  61.8 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  61.05 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  60.38 
 
 		 270 aa  337  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  62.64 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  60.89 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 278 aa  325  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 273 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  61.36 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 278 aa  316  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  61.74 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  62.41 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  55.64 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  36.88 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.7 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  40.77 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 278 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  36.7 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.58 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  36.23 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  38.25 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  37.65 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  39.48 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  37.6 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.83 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  35.85 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.22 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.66 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  32.47 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  33.96 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  36.94 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>