More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02293 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  67.56 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  60.69 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  57.63 
 
 		 270 aa  308  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  56.92 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  57.36 
 
 		 282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  55.77 
 
 		 268 aa  298  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  54.62 
 
 		 269 aa  295  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  54.23 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  58.08 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 272 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  53.85 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  55.98 
 
 		 267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  56.7 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  56.7 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  57.53 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  56.87 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  55.77 
 
 		 268 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  55.17 
 
 		 268 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  55.38 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  55.38 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  56.76 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  55 
 
 		 268 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  56.76 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  56.76 
 
 		 278 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  56.37 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  56.37 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  56.37 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  56.37 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  56.37 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 268 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  53.99 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  55.98 
 
 		 266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  37.25 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  38.67 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.47 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  36.05 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.44 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.86 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.26 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 268 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  35.57 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.75 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  35.04 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  33.74 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.87 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  31.03 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36.86 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.97 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  35.25 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>