92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2596 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 569 aa  1164    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.28 
 
 		 853 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.06 
 
 		 971 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2511  sensory box/GGDEF family protein  28.01 
 
 		 873 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.064044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1434  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 239 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3141  diguanylate cyclase  23.97 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.673343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  22.96 
 
 		 729 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0265  putative PAS/PAC sensor protein  26.27 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000305571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 		 628 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  27.63 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  26.38 
 
 		 820 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  25.14 
 
 		 514 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.3 
 
 		 876 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  29.36 
 
 		 603 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 1022 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  20.37 
 
 		 951 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.466049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 		 340 aa  87  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  29.28 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2602  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.44 
 
 		 821 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.981615  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 592 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.23 
 
 		 1003 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2314  sensory box/GGDEF family protein  30.21 
 
 		 874 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  24.03 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 1069 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.86 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  42.42 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2947  putative PAS/PAC sensor protein  27.42 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 968 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  27.07 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 1758 aa  73.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 1399 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 1071 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  38.54 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.36 
 
 		 1030 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.33 
 
 		 976 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2912  diguanylate cyclase  28.75 
 
 		 540 aa  67  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 		 1384 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1662  GGDEF domain-containing protein  24.16 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  30.66 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1907  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.29 
 
 		 1054 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 1055 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 2072 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.82 
 
 		 518 aa  63.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.83 
 
 		 1362 aa  61.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0421  putative PAS/PAC sensor protein  26.91 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.192636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 		 337 aa  57  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 771 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  27.95 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 630 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  25.76 
 
 		 666 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3501  diguanylate cyclase  25.56 
 
 		 526 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.493056  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000356  hypothetical protein  19.57 
 
 		 882 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.743126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1310 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 1276 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  21.83 
 
 		 547 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1874  GGDEF family protein  23.87 
 
 		 505 aa  54.7  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2608  GGDEF domain-containing protein  25.12 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0201696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 984 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  26.6 
 
 		 888 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  25.43 
 
 		 849 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 671 aa  50.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.143322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 826 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  19.9 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.61 
 
 		 953 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 		 738 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3396  GGDEF domain-containing protein  23.75 
 
 		 795 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5915  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 		 786 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.91558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3724  diguanylate cyclase  25 
 
 		 526 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.892379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0572  GGDEF domain-containing protein  25.15 
 
 		 777 aa  47  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3981  diguanylate cyclase  23.12 
 
 		 520 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 		 686 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.49 
 
 		 929 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 1648 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 656 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  23.33 
 
 		 613 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  24.54 
 
 		 524 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 652 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1071 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1051 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  24.83 
 
 		 733 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0991  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.59 
 
 		 607 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.964598 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2295  putative PAS/PAC sensor protein  31.91 
 
 		 259 aa  43.5  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>