49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0265 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0265  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 428 aa  882    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000305571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.8 
 
 		 876 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2511  sensory box/GGDEF family protein  32.84 
 
 		 873 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.064044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.17 
 
 		 853 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 		 971 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1003 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  31.65 
 
 		 820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1069 aa  146  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2314  sensory box/GGDEF family protein  30.32 
 
 		 874 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  27 
 
 		 729 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  31.44 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 510 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 1022 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3141  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.673343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 968 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 746 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0437  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.95 
 
 		 659 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 569 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2602  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.12 
 
 		 821 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.981615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1362 aa  90.5  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.26 
 
 		 1384 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 678 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.58 
 
 		 976 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.46 
 
 		 951 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.466049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.23 
 
 		 1030 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1907  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.97 
 
 		 1054 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4673  hypothetical protein  22.78 
 
 		 651 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53310  hypothetical protein  23.28 
 
 		 681 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 856 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1662  GGDEF domain-containing protein  22.79 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000356  hypothetical protein  22.76 
 
 		 882 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.743126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0977  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.35 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411883  normal  0.0692156 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1874  GGDEF family protein  24.83 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  19.25 
 
 		 1046 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2608  GGDEF domain-containing protein  25.74 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0201696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0572  GGDEF domain-containing protein  24.19 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3396  GGDEF domain-containing protein  24.75 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0221  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.93 
 
 		 786 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3981  diguanylate cyclase  20.79 
 
 		 520 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3501  diguanylate cyclase  21.72 
 
 		 526 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.493056  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 768 aa  47  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2912  diguanylate cyclase  23.78 
 
 		 540 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2558  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.42 
 
 		 1035 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1121 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0264  putative PAS/PAC sensor protein  24.59 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1692 aa  43.1  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>