195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1098 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
514 aa  1034    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  32.8 
 
 
510 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.6 
 
 
853 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2511  sensory box/GGDEF family protein  28.94 
 
 
873 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.064044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0265  putative PAS/PAC sensor protein  30.82 
 
 
428 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000305571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.07 
 
 
971 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3141  diguanylate cyclase  26.11 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.673343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  26.43 
 
 
820 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 
312 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  24.31 
 
 
729 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  40.29 
 
 
357 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
371 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  40.29 
 
 
388 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
678 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  34.73 
 
 
568 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  43.65 
 
 
509 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.29 
 
 
272 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
667 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 
976 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
1069 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  36.88 
 
 
290 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 
653 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2314  sensory box/GGDEF family protein  28.84 
 
 
874 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  35.26 
 
 
538 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  24.87 
 
 
569 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
746 aa  97.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.92 
 
 
876 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  32.83 
 
 
653 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 
694 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 
1362 aa  95.9  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  31.98 
 
 
523 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 
484 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 
559 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  28.22 
 
 
357 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  37.66 
 
 
430 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 
439 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  37.66 
 
 
428 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.6 
 
 
1003 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  30.47 
 
 
521 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 
638 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  41.94 
 
 
271 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2602  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.36 
 
 
821 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.981615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 
492 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  34.19 
 
 
295 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  34.08 
 
 
365 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  38.79 
 
 
323 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.74 
 
 
1022 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  26.56 
 
 
411 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 
359 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
445 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  39.66 
 
 
689 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  39.84 
 
 
271 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  33.17 
 
 
231 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 
281 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  39.23 
 
 
271 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  31.66 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  30.98 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  38.06 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  39.32 
 
 
655 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  32.39 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 
968 aa  84  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  35.07 
 
 
291 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  31.61 
 
 
344 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  29.66 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  33.55 
 
 
365 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  36.64 
 
 
295 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  32.09 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  34.87 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  34.39 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  34.85 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  36.75 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0363  anti-sigma-factor antagonist  34.35 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.700389  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 
363 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  32.59 
 
 
288 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
342 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
275 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0437  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.16 
 
 
659 aa  79  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  34.59 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  26.69 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  34.08 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  26.59 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  35.98 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 
549 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>