169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2424 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
317 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  37.83 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
321 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 
324 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 
318 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  46.1 
 
 
261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  32.6 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  34.05 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  47.54 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 
341 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  45.31 
 
 
359 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  33.48 
 
 
314 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  41.79 
 
 
331 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  42.97 
 
 
377 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 
325 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  37.58 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.17 
 
 
272 aa  92.4  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
430 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  37.42 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  37.06 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  37.41 
 
 
231 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  25.48 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 
388 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 
372 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  47 
 
 
376 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  39.1 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
523 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  28.43 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  39.32 
 
 
445 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  33.76 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  35.46 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2659  anti-sigma-factor antagonist  44.24 
 
 
342 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  28.43 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  38.17 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  36.29 
 
 
521 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  36.88 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  33.14 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  40.46 
 
 
509 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  37.07 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 
562 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
559 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  38.93 
 
 
653 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 
667 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.53 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  33.54 
 
 
556 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  41.44 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  34.96 
 
 
689 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 
568 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  32.68 
 
 
694 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  33.82 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  41.8 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  40.95 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  35.04 
 
 
358 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  39.23 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  36.52 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  42.27 
 
 
653 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  28.15 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  38.84 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  37.32 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  31.34 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  39.42 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  37.19 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
484 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 
580 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 
653 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  34.45 
 
 
510 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 
655 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  44.57 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.17 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  41.24 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  33.86 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 
549 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>