185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0221 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 366 aa  704    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  37.03 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  60.49 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  62.5 
 
 		 556 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  39.02 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  36.28 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  32.34 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  53.09 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  45.59 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  43.65 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  47.85 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  40.84 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  33.43 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  45.35 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  39.68 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  49.4 
 
 		 357 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  58.82 
 
 		 421 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  39.78 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  40.98 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  34.67 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  42.62 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  45.18 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  44.31 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  44.03 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 523 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  39.89 
 
 		 521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  51.3 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  47.41 
 
 		 568 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  43.56 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  47.83 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  43.36 
 
 		 433 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  43.38 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  45.9 
 
 		 290 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.54 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  35.26 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  46.03 
 
 		 638 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  44.8 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 580 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  42.57 
 
 		 424 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  41.3 
 
 		 694 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  43.8 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  42.75 
 
 		 439 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  42.02 
 
 		 275 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  43.09 
 
 		 653 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  41.04 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  33.18 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  38.93 
 
 		 306 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 689 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 538 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  37.11 
 
 		 549 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 		 281 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  33.17 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  38.21 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  39.71 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  44.14 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  41.53 
 
 		 667 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  38.73 
 
 		 231 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  37.58 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  45.67 
 
 		 286 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 280 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 		 286 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  38.81 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  30.2 
 
 		 377 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 288 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  43.33 
 
 		 286 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  40.8 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.37 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  41.48 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  32.12 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  35.22 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  38.35 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.18 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.24 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 272 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  35.43 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 287 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  42.48 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  36.03 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  40.8 
 
 		 653 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  42.48 
 
 		 284 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>