169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2646 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  73.6 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  63.31 
 
 		 314 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  60.42 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  47.47 
 
 		 314 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  50.64 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  60.66 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  45.09 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  52.99 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  45.14 
 
 		 359 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  55.8 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  47.56 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  45.9 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  45.3 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  52.9 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  46.1 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  43.92 
 
 		 318 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  46.72 
 
 		 509 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2659  anti-sigma-factor antagonist  44.17 
 
 		 342 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  46.04 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  45.26 
 
 		 429 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  44.08 
 
 		 549 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  41.96 
 
 		 439 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  44.6 
 
 		 430 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  43.88 
 
 		 428 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  48.03 
 
 		 357 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  42.25 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  37.13 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  36.18 
 
 		 388 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 		 562 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  42.76 
 
 		 538 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.67 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  33.86 
 
 		 380 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 365 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  36.55 
 
 		 385 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  42.61 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 372 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  43.65 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  39.31 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  31.1 
 
 		 385 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  38.97 
 
 		 445 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  38.41 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  45.61 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  41.32 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  42.28 
 
 		 653 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 655 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 433 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 357 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  45.87 
 
 		 376 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  43.12 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  44.17 
 
 		 667 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  40.71 
 
 		 559 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  46 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  46.36 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  43.24 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  44.93 
 
 		 653 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  49 
 
 		 653 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 580 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  33.53 
 
 		 361 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  40.65 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  40.67 
 
 		 388 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 521 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  39.5 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  41.06 
 
 		 421 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 568 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  30.65 
 
 		 371 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  42.5 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.12 
 
 		 366 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 		 362 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  41.53 
 
 		 638 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 350 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 361 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 689 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  41.96 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  30.65 
 
 		 325 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  42.98 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  42.06 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  39.72 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  44.95 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  38.94 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  38.17 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  37.41 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  31.02 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  38.41 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  36.91 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.55 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  44.55 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  38.58 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  43.56 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  30.99 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>