157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2635 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
355 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  45.9 
 
 
261 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  53.96 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  50.61 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  47.12 
 
 
321 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  55.15 
 
 
314 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  41.5 
 
 
377 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  48.2 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  42.27 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
359 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  39.55 
 
 
317 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  49.22 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  51.22 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  40.53 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  45.99 
 
 
331 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2714  anti-sigma-factor antagonist  71.01 
 
 
126 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  36.41 
 
 
357 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  41.04 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  40.29 
 
 
291 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  41.09 
 
 
428 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  40.43 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  40.44 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 
509 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  39.26 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  41.55 
 
 
653 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  45.05 
 
 
293 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  38.13 
 
 
549 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 
538 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  39.01 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  41.13 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  34.56 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  40.17 
 
 
275 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
428 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 
445 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  32.6 
 
 
439 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  45.54 
 
 
562 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 
653 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  41.27 
 
 
655 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  38.26 
 
 
568 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  41.27 
 
 
653 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
252 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  38.76 
 
 
559 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 
484 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  41.32 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  40.83 
 
 
280 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  39.69 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  38.57 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  38.76 
 
 
667 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  39.69 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  43.69 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.51 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  37.3 
 
 
580 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  39.34 
 
 
638 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  36.22 
 
 
689 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  37.39 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  34.42 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  27.46 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  33.86 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  33.14 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  40.54 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  35.61 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
549 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.54 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  39.66 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  39.5 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  36.43 
 
 
694 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  41.51 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  37.69 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  30.41 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>