More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2716 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  78 
 
 		 568 aa  832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 559 aa  1099    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  40.89 
 
 		 549 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  38.62 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 580 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  49.33 
 
 		 653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  44.56 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  37.39 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 357 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50.85 
 
 		 272 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  47.73 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  47.22 
 
 		 315 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  47.41 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  42.77 
 
 		 291 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  47.22 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 421 aa  124  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  44.64 
 
 		 372 aa  123  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  47.01 
 
 		 271 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  44.37 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  38.75 
 
 		 358 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 		 299 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  47.41 
 
 		 275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  44.9 
 
 		 549 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  41.85 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  46.63 
 
 		 357 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  47.59 
 
 		 509 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  48.72 
 
 		 271 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  41.86 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  45.4 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 		 388 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  46.55 
 
 		 282 aa  115  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  48.06 
 
 		 281 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  41.22 
 
 		 279 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  46.22 
 
 		 271 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  33.47 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  50.44 
 
 		 290 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  45.9 
 
 		 562 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  46.1 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  46.77 
 
 		 667 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.32 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  44.96 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  40.77 
 
 		 288 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  42.03 
 
 		 283 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.09 
 
 		 294 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  35.67 
 
 		 280 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  45.22 
 
 		 288 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 291 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  42.15 
 
 		 286 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  42.24 
 
 		 272 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  47.01 
 
 		 653 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  47.83 
 
 		 366 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 		 429 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  42.18 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  40.5 
 
 		 283 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 		 312 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  40.76 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  41.32 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  38.85 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  43.66 
 
 		 424 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  45.53 
 
 		 638 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  49.58 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  45.08 
 
 		 286 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 		 376 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  49.58 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  39.23 
 
 		 286 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  41.72 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  41.53 
 
 		 283 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 		 287 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 359 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  41.1 
 
 		 361 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.22 
 
 		 284 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  37.64 
 
 		 231 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  42.18 
 
 		 362 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  41.98 
 
 		 363 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  44.93 
 
 		 295 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  42.97 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  40.61 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 292 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 492 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  42.74 
 
 		 308 aa  100  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 363 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  42.03 
 
 		 298 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  39.76 
 
 		 371 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  36.69 
 
 		 694 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  44.19 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  39.52 
 
 		 255 aa  99.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  38.84 
 
 		 295 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  42.37 
 
 		 689 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  30.74 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>