198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2659 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2659  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
342 aa  657    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  44.17 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  39.41 
 
 
341 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  49.62 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  45.62 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  38.43 
 
 
317 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  53.12 
 
 
314 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  44.24 
 
 
317 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  53.12 
 
 
316 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  46.45 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  52.07 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  40.35 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  40.35 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  43.05 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  39.44 
 
 
372 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 
359 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  47.45 
 
 
357 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  41.77 
 
 
385 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 
439 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
430 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
428 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  46.34 
 
 
255 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 
288 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  44.85 
 
 
445 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  39.42 
 
 
306 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 
290 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  45.95 
 
 
271 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  40.37 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  40.97 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  39.85 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  45 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  41.45 
 
 
549 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.4 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  45.13 
 
 
521 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.09 
 
 
294 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  47.66 
 
 
283 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  38.26 
 
 
361 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  44.12 
 
 
562 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.6 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  44 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  40.88 
 
 
667 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  48.57 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  40.46 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 
288 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  39.04 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  41.18 
 
 
283 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  37.09 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  44.85 
 
 
280 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  45.24 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  44.8 
 
 
285 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  26.99 
 
 
359 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
365 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  41.79 
 
 
653 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  31.54 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  38.8 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  42.48 
 
 
523 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
372 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  41.22 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  40.13 
 
 
556 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  38.15 
 
 
549 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  45.04 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
653 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  39.47 
 
 
538 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  43.33 
 
 
292 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  43.2 
 
 
509 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 
365 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  37.58 
 
 
388 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  40.27 
 
 
424 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 
380 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  40.14 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  41.27 
 
 
428 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  41.35 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  48.48 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  43.33 
 
 
291 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.75 
 
 
359 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  42.5 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  43.81 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  42.28 
 
 
653 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  43.51 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
655 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  37.75 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  40.16 
 
 
252 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  39.53 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  38.52 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40 
 
 
285 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 
638 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  35.97 
 
 
385 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  36.69 
 
 
370 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
689 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  41.33 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  40.87 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  42 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  38.74 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>