189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3133 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  55.8 
 
 		 286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  54.35 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  52.48 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  57.46 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  52.24 
 
 		 288 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  63.55 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  50.18 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  56.25 
 
 		 285 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  52.33 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  48.2 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  47.14 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  52.06 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.53 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  48.34 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  46.76 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  51.87 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  51.85 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0363  anti-sigma-factor antagonist  43.77 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.700389  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  47.41 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  50.97 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  46.32 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  49.17 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  46.58 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  46.81 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.39 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  32.86 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  45.89 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  44.97 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  44.6 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  45.21 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  49.62 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  49.62 
 
 		 509 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  45.04 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  47.66 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  45.16 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  49.61 
 
 		 653 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  36.32 
 
 		 549 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  47.9 
 
 		 653 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 653 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  40.3 
 
 		 538 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  43.75 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  41.48 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 388 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  43.65 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  46.61 
 
 		 562 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  43.62 
 
 		 655 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  44.88 
 
 		 667 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  40.85 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  41.73 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  44.62 
 
 		 424 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 		 428 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  45.26 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  43.44 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  36.88 
 
 		 568 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  41.88 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  38.41 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  43.65 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  43.26 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  42.74 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  40.8 
 
 		 430 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  43.18 
 
 		 376 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  41.53 
 
 		 559 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 694 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  46.15 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  42.74 
 
 		 429 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  43.8 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 385 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  42.62 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  39.2 
 
 		 370 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 		 371 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 638 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  43.33 
 
 		 362 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 439 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  41.98 
 
 		 361 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  37.59 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 		 357 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  40.31 
 
 		 445 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  41.73 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  38.84 
 
 		 549 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  41.44 
 
 		 377 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 		 556 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  40.5 
 
 		 359 aa  92  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 363 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 689 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  42.5 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  37.12 
 
 		 325 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 231 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  39.67 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 510 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  38.03 
 
 		 365 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  40.5 
 
 		 580 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  39.67 
 
 		 388 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  37.9 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>