184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0129 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  58.84 
 
 
286 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  57.5 
 
 
288 aa  318  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  55.2 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  57.3 
 
 
288 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  54.35 
 
 
283 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  55.63 
 
 
294 aa  294  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  54.77 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  55.48 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  54.26 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  50.19 
 
 
284 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49.82 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  47.01 
 
 
288 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  51.32 
 
 
280 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  50.91 
 
 
272 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  47.74 
 
 
286 aa  255  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  49.27 
 
 
291 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  53.39 
 
 
279 aa  248  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  47.57 
 
 
283 aa  245  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  52.26 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  52.33 
 
 
285 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0363  anti-sigma-factor antagonist  44.57 
 
 
279 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.700389  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.04 
 
 
284 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  48.03 
 
 
295 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  67.2 
 
 
283 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  36.57 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  56.45 
 
 
272 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 
271 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 
271 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  48.65 
 
 
509 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  47.22 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  36.64 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  50.76 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  47.83 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  45.95 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  46.92 
 
 
653 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  51.91 
 
 
281 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  49.24 
 
 
293 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  46.88 
 
 
255 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  45.93 
 
 
358 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  49.23 
 
 
653 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  47.9 
 
 
653 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  43.94 
 
 
538 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  35.21 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  42.25 
 
 
549 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  46.22 
 
 
655 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  45.38 
 
 
562 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  45.38 
 
 
424 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  47.5 
 
 
388 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  46.72 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  44.92 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  42.65 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  46.46 
 
 
667 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  45 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  37.59 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  45.65 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  46.92 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 
421 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
430 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  44.54 
 
 
429 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  43.09 
 
 
286 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  38.93 
 
 
568 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  47.15 
 
 
312 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  44.07 
 
 
694 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 
559 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  41.41 
 
 
428 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 
252 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
323 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  38.96 
 
 
376 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  43.28 
 
 
372 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  42.74 
 
 
295 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
308 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  47.46 
 
 
361 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  47.5 
 
 
385 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  42.22 
 
 
439 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  40.32 
 
 
370 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  44.92 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  40.31 
 
 
371 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  41.22 
 
 
549 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  43.31 
 
 
445 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  39.1 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 
638 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  41.13 
 
 
689 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  42.15 
 
 
521 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
231 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  40.52 
 
 
556 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  45.45 
 
 
359 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  48 
 
 
377 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 
510 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  43.22 
 
 
359 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  43.97 
 
 
388 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
359 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  37.16 
 
 
365 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  40.83 
 
 
365 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  39.17 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  40.34 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
523 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  44.9 
 
 
377 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>