188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4192 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 380 aa  756    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  32.78 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  26.11 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  34.03 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  35.67 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  39.86 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  22.63 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  26.34 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 		 523 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  36.48 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  26.52 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 549 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  39.19 
 
 		 568 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 312 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  36.5 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  44.62 
 
 		 559 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  35.95 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 		 556 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  29.08 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  31.55 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  40.17 
 
 		 286 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  29.43 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  35.07 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  38.57 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  29.19 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.4 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  32.03 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  31.47 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  36.09 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  31.62 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  36.29 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 		 667 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  33.07 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  32.59 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  32.8 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  31.85 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  28.79 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  36.43 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  34.01 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  28.66 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3124  anti-sigma-factor antagonist  31.93 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  32.61 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  30.08 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  27.65 
 
 		 538 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  33.07 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  28.65 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  35.07 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 653 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  27.85 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 		 655 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>