156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3124 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3124  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
379 aa  764    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  41.3 
 
 
384 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 
580 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  33.15 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  36.24 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
506 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
361 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  35.76 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  28.25 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  31.06 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
559 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
568 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  31.16 
 
 
511 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  36.28 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
523 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  31.79 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  29.83 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  28.73 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  28.49 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  33.57 
 
 
549 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  34.85 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 
638 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  32.3 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  33.57 
 
 
689 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  25.97 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  29.38 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  34.03 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  28.96 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 
653 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  26.11 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  27.35 
 
 
521 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  29.53 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  34.45 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  34.25 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  31.54 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 
667 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  28.03 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.11 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  32.37 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 
433 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  28.15 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  27.14 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  30.13 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 
510 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 
509 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  28.66 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  29.71 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  29.11 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  26.27 
 
 
286 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 
291 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  29.2 
 
 
283 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 
694 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  30.47 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  27.32 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  28.93 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  29.93 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 
653 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.44 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  28.35 
 
 
514 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  27.34 
 
 
295 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 
655 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.45 
 
 
285 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  26.05 
 
 
288 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 
295 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>