155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0413 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 388 aa  761    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  31.22 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  44.23 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  30.26 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  29.38 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  36.87 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  29.39 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  39.34 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  38.52 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  32.52 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  35.66 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  37.59 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  41.27 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  32.45 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  29.38 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  33.95 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  27.23 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  34.4 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  36.15 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  37.82 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  37.41 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  37.17 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  30.92 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  41.12 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  41.35 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  40.19 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  32.09 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  30.25 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.83 
 
 		 272 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  33.05 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  36.56 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 568 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  39.42 
 
 		 559 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  31.45 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 638 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2740  anti-sigma-factor antagonist  28.68 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  29.77 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  30.95 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  33.11 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  35.03 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.63 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  29.92 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  28.93 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  32.26 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  30.89 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  25.67 
 
 		 231 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  31.97 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  33.85 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  29.51 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>