179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2740 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2740  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2741  putative phytochrome sensor protein  25.68 
 
 
302 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
2783 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  38.66 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  33.83 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  33.61 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.83 
 
 
961 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
3470 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  35.4 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 
421 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.4 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
549 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.78 
 
 
1480 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.59 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 
1332 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
689 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  31.2 
 
 
445 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  29.93 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 
638 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  34.97 
 
 
444 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.49 
 
 
957 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
492 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  27.4 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  28.91 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  28.46 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  33.05 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  31.15 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  30.33 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  27.48 
 
 
694 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  29.06 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.04 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  30.47 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  29.93 
 
 
367 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
580 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  25.29 
 
 
562 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 
511 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  28.1 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 
538 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  32.52 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  31.97 
 
 
388 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
492 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
2161 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 
357 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
380 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  30.33 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  28.81 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 
549 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 
653 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 
365 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  30.07 
 
 
425 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 
376 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  26.96 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  33.07 
 
 
523 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  28.1 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  26.98 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  31.62 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 
653 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  30.08 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  24.35 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  21.1 
 
 
411 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  25.41 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>