168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2741 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2741  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2740  anti-sigma-factor antagonist  25.68 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 3470 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  37.27 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  33.99 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 		 422 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  28.21 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  35.34 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  33.86 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  30.17 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  28.76 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.77 
 
 		 1480 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 2161 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  34.12 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  34.96 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 372 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  32.59 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 694 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.47 
 
 		 1568 aa  56.6  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 549 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  29.85 
 
 		 556 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 653 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 523 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  32.48 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  27.68 
 
 		 562 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  25.51 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 		 514 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 		 538 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  32.65 
 
 		 653 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  23.43 
 
 		 710 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.7 
 
 		 957 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 363 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 		 667 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0363  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.700389  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 2783 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 2153 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 		 484 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 365 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 424 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 		 703 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  26.56 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  32.04 
 
 		 549 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  28.78 
 
 		 365 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  27.12 
 
 		 653 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 445 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 		 492 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 905 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  32.53 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 433 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  26.72 
 
 		 655 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  26.89 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>