47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1434 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1434  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 569 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  40.54 
 
 		 906 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 		 628 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 603 aa  85.1  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 598 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.58 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  34.76 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  28.3 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  32.64 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  42.35 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0421  putative PAS/PAC sensor protein  45.07 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.192636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  42.35 
 
 		 449 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 1399 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 1055 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 2072 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  35.87 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  29.05 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1758 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 1276 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  45.07 
 
 		 340 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2947  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 686 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  29.67 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.83 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  27.59 
 
 		 710 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  34.83 
 
 		 888 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.8 
 
 		 582 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 800 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 		 760 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.77 
 
 		 801 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 697 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 849 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 540 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  30.34 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 688 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 858 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 		 857 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1420  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 		 543 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.108233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 		 883 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.55 
 
 		 1343 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 		 1287 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 690 aa  41.6  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>