142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2438 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2438  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0642  putative GAF sensor protein  40.94 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.344315  hitchhiker  0.000370263 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 1171 aa  68.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  28.97 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.6 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  26.19 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 323 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 878 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  34.39 
 
 		 1317 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  29.22 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2746  putative GAF sensor protein  30.52 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 471 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  26.88 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2566  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.57 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 437 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 680 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  25.64 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  25.64 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  27.1 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  28.8 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0155  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 404 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.4 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  41.43 
 
 		 879 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30.37 
 
 		 805 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.97 
 
 		 576 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  30.65 
 
 		 417 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  34.62 
 
 		 801 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 514 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  27.74 
 
 		 938 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.11 
 
 		 624 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  25.68 
 
 		 821 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 946 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.68 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 1001 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.66 
 
 		 740 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  37.5 
 
 		 824 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.46 
 
 		 321 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.39 
 
 		 722 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.56 
 
 		 727 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  28.12 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.4 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1149  putative GAF sensor protein  28.19 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711322  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2586  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  41.03 
 
 		 592 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  29.63 
 
 		 363 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  30.23 
 
 		 782 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.1 
 
 		 722 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 539 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  36.54 
 
 		 830 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  28.57 
 
 		 598 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.56 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.76 
 
 		 506 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  28.15 
 
 		 850 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  23.87 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 1002 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0220  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  28.57 
 
 		 598 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.6 
 
 		 322 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  23.27 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.33 
 
 		 1423 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.46 
 
 		 592 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  24.8 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.38 
 
 		 728 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1789  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.83 
 
 		 487 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0823  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 514 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  29.3 
 
 		 417 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  24.66 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  25 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  28.03 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 1965 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.86 
 
 		 441 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  27.78 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 1550 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 401 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 677 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  23.87 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  24.8 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 662 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 2153 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 389 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.27 
 
 		 718 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  23.11 
 
 		 781 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.54 
 
 		 594 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 1016 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  33.04 
 
 		 393 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  26.67 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 943 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.56 
 
 		 348 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.56 
 
 		 348 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.06 
 
 		 465 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  28.7 
 
 		 165 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 513 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  32.71 
 
 		 1041 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 		 531 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>