182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1149 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1149  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711322  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0367  putative GAF sensor protein  43.56 
 
 		 322 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1064  GAF domain protein  38.5 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.665993  normal  0.536092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30.86 
 
 		 805 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  26.79 
 
 		 801 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 1171 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  30.43 
 
 		 879 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 441 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  27.38 
 
 		 782 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  27.65 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 518 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.66 
 
 		 465 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 878 aa  64.7  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  28.29 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.17 
 
 		 1423 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.63 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.09 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  28.05 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  26.9 
 
 		 830 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  26.9 
 
 		 824 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.05 
 
 		 1550 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  26.49 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0155  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  30.22 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.01 
 
 		 531 aa  58.2  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  28.05 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 680 aa  58.2  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 837 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  29.14 
 
 		 874 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  24.29 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  27.34 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  29.5 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 662 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  27.64 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  24.29 
 
 		 441 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  26.97 
 
 		 743 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  25.28 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0823  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  28.78 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  28.78 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  25 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  21.84 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0642  putative GAF sensor protein  29.33 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.344315  hitchhiker  0.000370263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  26.62 
 
 		 669 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2455  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 699 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  30.18 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.33 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.85 
 
 		 737 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 514 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  27.4 
 
 		 1428 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  29.41 
 
 		 595 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1687  putative GAF sensor protein  26.92 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  26.27 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1789  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.62 
 
 		 487 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.41 
 
 		 319 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 321 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.14 
 
 		 367 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.23 
 
 		 506 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.46 
 
 		 445 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.28 
 
 		 722 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.92 
 
 		 326 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 946 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  21.15 
 
 		 249 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 864 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.97 
 
 		 722 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  21.15 
 
 		 249 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.19 
 
 		 576 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2350  putative GAF sensor protein  25.81 
 
 		 305 aa  51.6  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2746  putative GAF sensor protein  26.14 
 
 		 169 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 321 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  26.57 
 
 		 938 aa  51.2  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.42 
 
 		 442 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.49 
 
 		 722 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  26.62 
 
 		 327 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.68 
 
 		 348 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4958  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 517 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  24 
 
 		 542 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.68 
 
 		 348 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  24.71 
 
 		 607 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.27 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  22.09 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  20.11 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  25 
 
 		 781 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  25 
 
 		 780 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  25.95 
 
 		 393 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  24.49 
 
 		 417 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2096  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 584 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  24.14 
 
 		 607 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00678  Putative signal protein with GAF, GGDEF and EAL domains  29.6 
 
 		 595 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0927231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 1309 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 1002 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 403 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.48 
 
 		 921 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>