293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3585 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  99.57 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  54.19 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4745  putative GAF sensor protein  49.12 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0493146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  38.89 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  58.49 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  38.2 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 		 441 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 		 441 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  40.79 
 
 		 364 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  36.31 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 681 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 1171 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 579 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.27 
 
 		 595 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.09 
 
 		 506 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  37.5 
 
 		 431 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  35 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  35 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  38.16 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.84 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.67 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.84 
 
 		 781 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  40 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  38.36 
 
 		 398 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  40 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.12 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  39.44 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  37.16 
 
 		 743 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  36.94 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  38.73 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  35.76 
 
 		 794 aa  101  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  40.14 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  38.73 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.51 
 
 		 326 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  35.26 
 
 		 316 aa  99.4  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  32.34 
 
 		 417 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.14 
 
 		 743 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.6 
 
 		 576 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 837 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.84 
 
 		 531 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 1550 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 321 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  36.55 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  32.32 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 680 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  36.55 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  35.4 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  35.4 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 1002 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  33.12 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  35.76 
 
 		 327 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.89 
 
 		 336 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.78 
 
 		 323 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 336 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 403 aa  91.7  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.95 
 
 		 780 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.54 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 539 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 929 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  37.14 
 
 		 406 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  34.15 
 
 		 874 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  34.69 
 
 		 594 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 399 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  35.14 
 
 		 669 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  38.28 
 
 		 400 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1965 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  34.46 
 
 		 344 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  32.67 
 
 		 324 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  34.87 
 
 		 732 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  33.33 
 
 		 413 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 413 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 413 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.95 
 
 		 442 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 930 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 878 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 323 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  42.02 
 
 		 930 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  35.14 
 
 		 321 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35 
 
 		 727 aa  88.6  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.1 
 
 		 323 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  31.1 
 
 		 323 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  39.68 
 
 		 422 aa  88.2  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1309 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  31.1 
 
 		 323 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.21 
 
 		 624 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.3 
 
 		 323 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  35.76 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 438 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 		 1224 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.16 
 
 		 728 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 600 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 514 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00678  Putative signal protein with GAF, GGDEF and EAL domains  36.44 
 
 		 595 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0927231  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 934 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1789  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.23 
 
 		 487 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  33.77 
 
 		 407 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 946 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  41.01 
 
 		 603 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>