More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4958 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4958  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 517 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  57.06 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0964  GAF sensor signal transduction histidine kinase  56.02 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  46.24 
 
 		 518 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0823  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 		 514 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0602  histidine kinase  25.45 
 
 		 843 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.74 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.74 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  24.1 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.32 
 
 		 878 aa  83.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  29.7 
 
 		 594 aa  83.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1550 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.41 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0345  histidine kinase  29.17 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.21 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.63 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  29.73 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  30 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  31.94 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  25.47 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  21.85 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  30.27 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0220  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  30.93 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  30.93 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 864 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 		 837 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  30.82 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 941 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 680 aa  75.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  28.89 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1118 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.47 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  20.75 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  30.5 
 
 		 607 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.1 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  29.86 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  24.31 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.53 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  24.31 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.11 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 934 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  28.86 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  27.08 
 
 		 669 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 1046 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  29.22 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  29.22 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 		 1977 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  30.5 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1021  histidine kinase  25.84 
 
 		 1109 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  31.69 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  23.62 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 853 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  27.18 
 
 		 732 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  24.07 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  28.1 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 763 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3776  hypothetical protein  26.95 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 763 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  28.06 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.27 
 
 		 781 aa  70.1  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  27.45 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  29.94 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.7 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.08 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 880 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  31.08 
 
 		 165 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  26.56 
 
 		 835 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  30.87 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 837 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.03 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  28.38 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  27.45 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  28.86 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30.94 
 
 		 805 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  29.71 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3481  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  28.78 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>