More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1021 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1021  histidine kinase  100 
 
 		 1109 aa  2256    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3802  histidine kinase  42.05 
 
 		 1121 aa  703    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  61.98 
 
 		 1118 aa  1326    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  49.36 
 
 		 828 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  49.36 
 
 		 851 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0602  histidine kinase  40.26 
 
 		 843 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0345  histidine kinase  33.57 
 
 		 861 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  32.51 
 
 		 1200 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1352 aa  238  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  37.11 
 
 		 1937 aa  235  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1159 aa  235  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1046 aa  235  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 2107 aa  234  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 1937 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  35.31 
 
 		 1161 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1917 aa  232  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1936 aa  231  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1942 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 974 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1937 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1142 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 1143 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1162 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  35.14 
 
 		 556 aa  224  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1201 aa  224  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  32.85 
 
 		 613 aa  223  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1141 aa  219  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  34.22 
 
 		 603 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 573 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  35.56 
 
 		 548 aa  217  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1158 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1839 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1782 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1195 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1131 aa  214  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1168 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 1274 aa  214  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 1695 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1038 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 975 aa  213  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1857 aa  213  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1145 aa  212  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 2037 aa  211  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  28.28 
 
 		 1158 aa  211  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 2099 aa  211  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1977 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 927 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.48 
 
 		 1137 aa  209  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1271 aa  207  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1954 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 1203 aa  207  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 2099 aa  206  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  32.33 
 
 		 1196 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1896 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1362 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.83 
 
 		 1361 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1137 aa  205  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1163 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 687 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 733 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1155 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1149 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 2010 aa  202  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1177 aa  202  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1964 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1155 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 1356 aa  201  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 970 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 		 1170 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  30.57 
 
 		 1172 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1155 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 754 aa  197  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 1680 aa  197  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 858 aa  197  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 1713 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1165 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 823 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 917 aa  196  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 853 aa  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 989 aa  195  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1172 aa  194  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1155 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1853 aa  194  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 977 aa  193  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1195 aa  193  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 791 aa  193  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1161 aa  193  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 1003 aa  193  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  29.6 
 
 		 998 aa  191  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  31.96 
 
 		 651 aa  191  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 991 aa  190  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 721 aa  190  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1158 aa  190  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1022 aa  189  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  32.26 
 
 		 1278 aa  189  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1843 aa  189  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 798 aa  188  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1037 aa  188  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1194 aa  188  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  30.72 
 
 		 1374 aa  188  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>