More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0991 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 513 aa  1047    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0964  GAF sensor signal transduction histidine kinase  99.42 
 
 		 513 aa  1042    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4958  GAF sensor signal transduction histidine kinase  57.06 
 
 		 517 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 518 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0823  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 514 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0602  histidine kinase  32 
 
 		 843 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1550 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0345  histidine kinase  31.55 
 
 		 861 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  34.9 
 
 		 607 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 		 851 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  26.86 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.73 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 653 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  30.57 
 
 		 276 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 267 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 890 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  32.21 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.27 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  22.16 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.38 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 843 aa  76.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 754 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 837 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  27.03 
 
 		 556 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  28.75 
 
 		 325 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.7 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 1002 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1118 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  30.82 
 
 		 595 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.03 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 878 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  29.01 
 
 		 344 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 364 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  30.87 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  27.5 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  23.97 
 
 		 774 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  23.6 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  27.33 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  28.75 
 
 		 594 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.73 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  29.05 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 573 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 941 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 838 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  30.41 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  27.52 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.2 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.52 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  29.19 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  27.99 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3802  histidine kinase  25 
 
 		 1121 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  27.52 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1046 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  25.47 
 
 		 249 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  25.47 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  30.46 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1021  histidine kinase  27.42 
 
 		 1109 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  26.25 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  30.47 
 
 		 835 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  22.74 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  28.47 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.67 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  26.38 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  26.25 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.67 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  24.09 
 
 		 771 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.17 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  25.99 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.37 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  26.11 
 
 		 837 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 318 aa  67  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  27.92 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 764 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.73 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.52 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  22.15 
 
 		 398 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  27.52 
 
 		 600 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 1309 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.1 
 
 		 740 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 531 aa  66.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>