218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2036 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  53.48 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  38.89 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  38.89 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  38.89 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  41.48 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4745  putative GAF sensor protein  38.79 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0493146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  42.48 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 1171 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  35.67 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 441 aa  99  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 441 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 364 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.44 
 
 		 576 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 680 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.52 
 
 		 326 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  29.87 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 579 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  29.03 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  33.59 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.39 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  32.62 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  31.91 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  32.62 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  31.91 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.06 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 878 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  31.1 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  29.45 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.41 
 
 		 531 aa  72  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.83 
 
 		 445 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0964  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  29.3 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 518 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.3 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  30.26 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 		 930 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  28.75 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 681 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  29.68 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1309 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  29.33 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  28.95 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  31.33 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  28.95 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.95 
 
 		 624 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  28.95 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  27.71 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.61 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.88 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.39 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.39 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  28.03 
 
 		 595 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 1001 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  30.59 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  29.22 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  25.17 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.39 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  29.93 
 
 		 781 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  28.39 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.86 
 
 		 1179 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2010  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.63 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  28.39 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2096  diguanylate cyclase  34.85 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 1550 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4958  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 517 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0318  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  30 
 
 		 601 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.899318  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  24 
 
 		 794 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  31.54 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 897 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.14 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1203 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  28.39 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  30 
 
 		 732 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 		 932 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.3 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.82 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.34 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  25.16 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 1002 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1789  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.47 
 
 		 487 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  22.98 
 
 		 780 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.74 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 		 956 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.78 
 
 		 740 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.45 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  29.37 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  26.62 
 
 		 598 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 398 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.48 
 
 		 722 aa  55.1  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  24.52 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 399 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>